中文Noua tulpină variantă de coronavirus 501Y-V2 din Africa de Sud
Pe 18 decembrie 2020, Africa de Sud a detectat un mutant 501Y-V2 al noului coronavirus.Acum mutantul sud-african s-a răspândit în peste 20 de țări.Experimentele au arătat că, deasupra noilor mutanți ai virusului corona, pot purta și alte variante ale noului coronavirus ale mutațiilor K417N/T, E484K și N501Y care pot reduce capacitatea de neutralizare a anticorpilor de neutralizare a plasmei induși de vaccin.Cu toate acestea, în comparație cu genomul de referință Wuh01 (numărul de secvență MN908947), secvența genomului mutant 501Y.V2 din Africa de Sud are 23 de variante de nucleotide.Are aceeași mutație N501Y ca și subtipul mutantului Britain B.1.1.7, dar încă conține mutații la două locuri cheie E484K și K417N ale proteinei S care au efecte potențial importante asupra capacității virusului de a infecta.
Noul coronavirus este un virus ARN monocatenar, a cărui mutații ale genomului sunt mai frecvente.Detectarea cu o singură țintă poate duce cu ușurință la detectarea ratată a probelor cu încărcătură virală scăzută și tulpini de virus mutante.Rata de reexaminare în unicul pozitiv în detectarea țintei, poate ajunge la peste 10%, ceea ce poate crește volumul de muncă și poate prelungi timpul de diagnosticare.Detectarea mai multor ținte și verificarea reciprocă a rezultatelor fiecărei ținte pot crește rata de detectare și pot facilita diagnosticarea precoce.
Figura 1. Diagrama schematică a mecanismului de infectare cu noul coronavirus
Noul mutant al coronavirusului B.1.1.7 din Marea Britanie
Pe 26 decembrie 2020, prima lucrare științifică a tulpinii B.1.1.7 a fost publicată online.Institute of Hygiene University of London UK and Tropical Diseases, a confirmat că tulpina B.1.1.7 este mai capabilă să se răspândească decât alte tulpini, care a fost mai mare de 56% (95% CI 50-74%).Deoarece această nouă tulpină mutantă are o putere de transmitere mai evidentă, a devenit mai dificil de controlat COVID-19.A doua zi, Universitatea din Birmingham din Regatul Unit a încărcat un articol despre MedRxiv.Studiul a constatat că numărul de copii ale genelor virusului ORF1ab și N la pacienții infectați cu tulpina mutantă B.1.1.7 (abandonul genei S) a fost semnificativ crescut;acest fenomen a fost monitorizat în populaţie.Acest articol subliniază că pacienții infectați cu mutantul B.1.1.7 din Marea Britanie au o încărcătură virală semnificativ mai mare, așa că acest mutant poate fi și mai patogen.
Figura 2. Secvența de mutație a genomului conținută în tulpina mutantă de coronavirus B.1.1.7 din Marea Britanie
Figura 3. Mutația N501Y a avut loc atât în Marea Britanie, cât și în Africa de SudVariante
Kit de detectare a noilor variante de coronavirus
Chuangkun Biotech Inc. a dezvoltat cu succes un kit de detectare pentru noile variante de coronavirus B.1.1.7 și 501Y-V2.
Avantajele acestui produs: sensibilitate ridicată, detectarea simultană a 4 ținte, acoperind principalele locuri de mutație ale tulpinii mutante B.1.1.7 și ale tulpinii mutante 501Y.V2 din Africa de Sud.Acest kit poate detecta simultan site-urile de mutație N501Y, HV69-70del, E484K și noua genă a coronavirusului S;Test rapid: durează doar 1 oră și 30 de minute de la colectarea probei până la rezultat.
Figura 4. Detectarea curbei de amplificare a variantei britanice COVID-19
Figura 5. Detectarea curbei de amplificare a variantei din Africa de Sud COVID-19
Figura 6. Curba de amplificare a noului coronavirus de tip sălbatic
Nu este clar cum aceste mutații acumulează un nou impact pe termen lung al pandemiei COVID-19.Dar acest lucru ne reamintește că aceste mutații pot afecta eficacitatea imunității naturale și a imunității determinate de vaccinare.De asemenea, ne reamintește că trebuie să monitorizăm continuu noul coronavirus pentru o lungă perioadă de timp și să actualizăm vaccinul COVID-19 pentru a face față evoluției noului coronavirus.
Ora postării: 12-mar-2021